Сразу скажу, что с апгрейдом Drupal я намучился и потратил на это не один час. Увы, система сделано очень крисов и требует массовых патчей для корректного обновления. Основные проблемы с обновлением SQL таблиц для используемых модулей.
Вот последовательность, которую я рекомендую. Она получена методом проб и ошибок.
- Для всех модулей, которые вы будете продолжать использовать, скачайте новые версии для Drupal 7.
- Отключите все модули, кроме Core. Удалите модули через админ панель, которые вы не будете использовать, чтобы почистились SQL таблицы (например, FCKeditor). После удаления модуля, удалите его папку.
- Создайте файл php.ini, положите в корень сайта и добавьте в него следующие строки:
Подробнее Тонкости и проблемы при апгрейде Drupal с 6 на 7 версию