Как известно, при установке обновлений Windows, файлы обновлений сначала скачиваются в системные папки, и после установки обновлений… там и остаются. Поэтому, размер папки Windows все время растет. За год папка толстеет на 6-10 Гбайт. Это же происходит, когда вы ставите программы, дистрибутив которых выполнен в виде msi файла. И это помимо массы временных файлов, которые создаются во время установки. Как удалять временные файлы, я думаю, вы знаете.
Подробнее Удаление ненужных файлов обновлений для очистки Windows